地デジの再生がショートカットキーで止まるんです

あくまでも想像の域を出ませんが.....。

実は公開されていないショートカットキーの組み合わせがあって、
それに Ctrl＋Sが該当している、という可能性はありますね。
→Ctrl＋Sの組み合わせが「静止画キャプチャ機能」になっているとか。

この場合だと「ソフトウェアが動作している際にどちらがキー入力権限を優先取り込みするのか？」という制御を OSである Windows 10が行っている関係上、地デジ映像を流している PCastTV側が実は優先権が高い状態、と考えるしかないように思います。

※地デジなどの映像・音声をそのまま PC画面上に流す場合、
　オーバーレイ(上書きしてしまうこと)の技術を使っているので、その
　機能を利用する際に併せてキー入力優先権を奪っている可能性が
　考えられる、という程度ですが.....。

サポートを受けられそうだったらメールベースででもバッファローに問い合わせてみて有用な情報が入手できれば、という程度ですが、それ以外だと仰るようにかなり難しいような気はします。

追伸：ちなみに消極的な回避策としては
●PC上で地デジ見ず、TVで直接見る
●Windows 10対応の同等製品に買い換える
●地デジ再生とご指摘のショートカットキー動作を同時に実行しない

あたりになるかと思います。

著作権保護機能が動いているかも知れませんね。
スクショ禁止があったりするので…

ソフト（PCastTV for 地デジ Lite）のチャンネル切替は Page Up/Downのようですから、ソフト側のショートカットではなさそうですね。

地デジのHDCP（著作権保護）の問題では？。コピー（Ctrl+C）やPrint Scrn等が出来なくなるなんて話は散見したことがあります。