au　iphone6s とipad Air2　移行のタイミングについて

＞切り替えは、NMP期限の6/25までに行えばいいのでしょうか？

できれば6/23までに行ってください。
mineo公式HPの注意事項に「ご自身でMNP切替をされない場合は、MNP有効期限前日に切替手続きをさせていただきます。」とありますので、6/24に強制切替になります。
不意に切り替わって使えない状況になると困ると思うので、6/23までの切替作業が良いと思います。

＞ipadは月末までに解約すればいいとの事だったので、ipadだけはNMPの期限は関係なく月末まで使用できると言う事でしょうか？

解約までは使えます。
月末に解約すれば、月末までは使えます。
ipadは通話のないデータ通信契約なので、mineoへのMNP（乗り換え）が発生しません。
なので、単純にauの解約となります。
そして、auは契約最終月が日割り計算されないので、6月中であればいつ解約しても6月末までの料金が課せられます。
従って、「月末までに解約すればいい」という事になります。

それと、蛇足ですが・・・

ipadを今まで通り利用しようとするなら、データSIM（mineoの場合はシングルプラン）を契約してSIMを挿さないと使えないです。
iPhone6sのテザリング等、Wifiで利用するなら、ipadの契約は特に不要です。
この辺、興味があるようでしたら詳しくご案内致します。

ご参考になれば。

こんにちはmomomo1 さん

>切り替えは、NMP期限の6/25までに行えばいいのでしょうか？

>期限ギリギリになって慌てて切り替えるというのも嫌なので、
余裕を持って２日前くらいには切り替えを完了させたいとは思います。

MNP有効期限が6/25なので、何もされなければ、6/24にmineoで強制切り替えがされます。
ご自身でされる場合、6/23までにされると良いと思います。
切り替えが20時以降だと、翌日の切り替え作業（auでの作業）になる可能性があるので、早めの時間が良いと思います。

>「ipadの方はNMPではないので、解約を今月までに店舗でして下さい。
今現在の契約はiphoneとセットの契約になっているので、単品の契約に切り替えます。」

気になるのは上記です。
iPad Air2の料金が、セットだった時より高くなるということはないでしょうか？
差額が小さければ良いのですが。

iPad Air2の契約は、おそらく日割り計算がないと思います。

・iPad Air2の料金が、セットだった時より高くなっていない
・iPad Air2の料金は6月末まで利用しても、それより前に解約しても変わらない

上記をauショップに確認してご判断されると良いと思います。

余談ですが、Aプランは現在テザリング不可ですが、現在mineoでテザリングができるよう、討議中とのことです。
将来的にテザリングが可能になれば、iPad Air2のの利用頻度がそれほど高くなければ、iPhone 6sでテザリング運用しても良いかもしれませんね。
（この場合、電源の消費が早くなりますので、モバイルルーターはあった方が安心です）