au　iphone6s とipad Air2　移行のタイミングについて

こんにちはmomomo1 さん

>切り替えは、NMP期限の6/25までに行えばいいのでしょうか？

>期限ギリギリになって慌てて切り替えるというのも嫌なので、
余裕を持って２日前くらいには切り替えを完了させたいとは思います。

MNP有効期限が6/25なので、何もされなければ、6/24にmineoで強制切り替えがされます。
ご自身でされる場合、6/23までにされると良いと思います。
切り替えが20時以降だと、翌日の切り替え作業（auでの作業）になる可能性があるので、早めの時間が良いと思います。

>「ipadの方はNMPではないので、解約を今月までに店舗でして下さい。
今現在の契約はiphoneとセットの契約になっているので、単品の契約に切り替えます。」

気になるのは上記です。
iPad Air2の料金が、セットだった時より高くなるということはないでしょうか？
差額が小さければ良いのですが。

iPad Air2の契約は、おそらく日割り計算がないと思います。

・iPad Air2の料金が、セットだった時より高くなっていない
・iPad Air2の料金は6月末まで利用しても、それより前に解約しても変わらない

上記をauショップに確認してご判断されると良いと思います。

余談ですが、Aプランは現在テザリング不可ですが、現在mineoでテザリングができるよう、討議中とのことです。
将来的にテザリングが可能になれば、iPad Air2のの利用頻度がそれほど高くなければ、iPhone 6sでテザリング運用しても良いかもしれませんね。
（この場合、電源の消費が早くなりますので、モバイルルーターはあった方が安心です）