mineo電話アプリ

他の方も回答されていますが、ご主人の連絡先が２つのアカウントと同期しているために、そのような重複した表示になるのではないかと思いました。

連絡先の編集画面で、「インポート元」という項目を確認してみてください。（添付画像の赤線部分）
「本体」と「Google」など、２つのアカウントが表示されていませんか？

どちらか一方のアカウントに登録しておけばよいのであれば、以下の方法で重複表示を直すことができます。
なお、以下の説明はP10ではなくP10liteの設定画面をもとに書いています。
おそらく、同じような感じではないかと思うのですが、多少異なるところがあるかもしれません。
その場合は、ご容赦ください。

①「連絡先」アプリでご主人のものを開き、右下の「その他」から「連絡先を分割」を選択。

②ご主人の連絡先が２つになるので、必要ない方を削除。
このとき、どちらがどちらのアカウントに登録している連絡先なのかは、
・「mineoでんわ」アプリの連絡先から該当のものを選択し、「同期しているアカウント」
・「連絡先」アプリから該当のものを選択し、編集画面の「インポート元」
のどちらかの項目にて、確認することができます。

端末標準の電話帳ではどうなっていますか。その電話帳で片方を消せば消えると思います。それでも消えない場合は、端末本体とGoogleのアカウントの両方に同じデータがはいっていて両方表示する設定になっているかもしれません。

それは、連絡先に同じ携帯電話番号が２件並んでいるのに、いざ編集しようとしたら、１つ消えるという事でしょうか？
一度電話帳アプリを終了(右下の□を押して電話帳アプリを×を押して終了)し、再度電話帳アプリを開いても直りませんか？

また、もし発信履歴の事をおっしゃっているなら、
mineo電話アプリについては使った事がないので詳細が分からないのですが、
mineo電話アプリから発信した履歴を、デフォルトの電話アプリの発信履歴に統合するような設定になっていると、通常発信とアプリ発信の２つが並んで表示されている可能性もあります。

００６３が追加された番号の分がついたものが増えたなら普通です。

googleの連絡先がおかしくなってるのでは
パソコンがあればそちらで確認してみましょう