eSIMで楽天モバイルを主に。mineoを副回線にしたかったのですが…。

何の問題もありませんよ。
> 新しい楽天iPhoneSE3に副回線としてのSIMカードを入れて使用
このためには、mineoのAプラン用プロファイルをダウンロードだけして、その後一時的に楽天モバイルのSIMをオフにした状態でAプラン用プロファイルをインストールします。
もう一度楽天モバイルのSIMをオンにすればDSDVで使えるようになります。
モバイルデータ通信にはmineo SIMを、通話には楽天モバイルSIMを設定しておきましょう。