SIMが無効ですの原因について

まず、確認ですが、ワイモバイルのiPhoneSEはご自身がもともとお使いのiPhoneSEでしょうか？ それとも、メルカリ等の「個人取引」で購入でしょうか？ あるいは、イオシスやじゃんぱらといった中古屋さんでの購入でしょうか？

まず、「SIMが無効です」ということは、そのiPhoneSEはSIMロックがかかっている状態ですね。
もし、ワイモバイル利用中にiPhoneSEを修理に出して、端末の交換をしている場合、ワイモバイル登録のiPhoneSEのIMEI（製造番号）とお持ちのiPhoneSEのIMEIは違うハズです。
または、回線切り替えをする前にMy Y!mobileでSIMロック解除の手続きを完了していない可能性もあります。
これらの場合は、一度ワイモバイルショップに足を運んで、回線切り替え後90日以内と思われますから、場合によっては、3,240円のSIMロック解除代がかかることも想定されます。
これでワイモバイル上のSIMロック解除は完了ですが、iPhoneSEそのもののSIMロック解除が必須になります。ここで、「nanoSIM」を挿入すると、アクティベーションロックがかかりますが、Wi-Fi接続後 Apple IDとパスワードの入力で、正しければiPhoneSEそのもののSIMロックが解除されます。

個人取引でiPhoneSEを購入している場合は、一度購入元に確認してみましょう。