pdfがアプリでないと開けない

何故紐付けが解けてしまったのかは判りませんが、pdfビューワーを一端消せるなら再インストールしてみるかまたは、acrobat reader入れてみたら如何ですか？

　何らかの原因でそれまでデフォルトでpdfファイルを開いていたアプリの設定が解除されたためと思われます。
　Androidのバージョンによって表示の仕方が違うかもしれませんが、pdfファイルをタップしたときに、「アプリを選択するダイアログが表示され “今回のみ（一回のみ）” や “常時（常に）”」というような表示が出てくるはずですが…
　そのときに「常時（常に）」を選ぶと、次回からそのアプリで（ダイアログが開かずに）自動的に起動するようになるはずです。「今回のみ（一回のみ）」を選ぶと、毎回ダイアログが出てしまい、そのつど設定を選ばなければなりません。