マイネ王と連携は1回線のみ？

＞2回線持っている場合、どちらか一方のみしかeoIDと連携できないのでしょうか。

そうなります。
どちらかの回線を選んで切り替える事は出来ますが、同時に連携できるのは1回線だけです。

＞2つのeoIDを作らなくてはいけないのですか。

既に契約済みのため、今からeoIDを分割する事は出来ません。
どうしてもという事になると、一度解約して別のeoIDで再契約する事となります。

＞契約者が同じ場合、パケットを送りあったりはできるのでしょうか。

パケットギフトは別々のeoID間でないと利用できません。
(mineoが改善を検討しているようですが、現状では同一eoID間のパケットギフトは不可です)

従って、C-ちゃんさんが同一eoIDで2回線契約しているのでしたら、直接のパケットギフトは出来ない事となります。