ウイルス感染？

あくまで私見です。
ポップアップが出た時点であれば大抵がフェイクなので、そのタブ/ページを削除してブラウザのキャッシュをクリアしてください。それ以上そのサイトにアクセスしなければ悪さをしないでしょう。ポップアップを見て慌ててそのURLをタップしたりするのは悪手です。

iPhoneに対してセキュリティアプリによる端末内のウイルスチェックは効果は薄いはずです（その必要がないから使った事はありません）。一度セキュリティアプリの説明を読んでみてください。また、App Storeにおいて提供元やアプリのプライバシーを確認して怪しいと感じたものはダウンロードしないことです。

興味本意で覗いてみたいのは理解しますが、やばそうと感じたサイトには二度とアクセスしないのが安全だと思いますよ。

"ウイルス感染"見たいなポップアップは、
そのポップアップに従って何かをすると、不利益を得るパターンの詐欺的な何かです。
もし本当に"ウイルス感染"しているとすると、(貴方が)セキュリティを入れている訳でもないのに、そんなポップアップを出すのはとても不自然です。"ウイルス"にしてみると、黙っているのが得なハズですよね、普通に考えると。
ただ、貴方が危険なサイトを見ているのは確かなので、そんなサイトを閲覧するのは、これからは避けましょう。何らかの心当たりはあるのでは無いですか。ご注意下さい。

参考にしてみてください

こちらは、PCでの
トロイの木馬に感染したかも？症状や駆除方法を解説
PCホスピタルColumn by日本PCサービス
https://www.4900.co.jp/smarticle/13036/

何度も出たので怖くなってしまいました。
ポップアップが出たサイトは覚えていませんが、もしまた出たら無視して画面を閉じようと思います。
回答をしてくださった皆様、ありがとうございました。

●まず今回のポップアップは広告なので簡単に消すことが出来たのだと思います。
●本物の詐欺サイト・悪質サイトのポップアップは簡単に消せない様になっていて不快な警告音も鳴り続けます。

●単なるポップアップ詐欺広告(今回？)
→パソコンを遠隔操作で直すと言って高額なサポート詐欺に持ち込む？
●詐欺サイトによるポップアップ？
→高額請求(エ◯サイト閲覧費用・架空請求→支払う必要は無いが家族にバレない様にと払ってしまう被害者が多い→これもエ◯サイトのポップアップ詐欺広告の可能性も？)
こちらのサポート詐欺もあって今問題になっている(添付の動画)
(→ESCボタン長押しで消える)
●本物のコンピューターウィルス感染

【今回の構造(私も詳しくは有りませんが)】
●普通のサイトが報酬を得るために広告を載せる。
(通常はバナー広告や、サイトを開くと同時にポップアップ広告が出てそれを閉じないとサイトが読めない)
●その広告(バナーやポップアップ)には広告代理店がいて
●その広告にお金を払って掲載するスポンサーがいる。
●今回はそのスポンサーが詐欺会社だった。
●広告代理店はその詐欺会社をちゃんとチェックしているのかグルなのかは不明(広告を掲載する前と後)。
●サイト運営者と広告代理店の間にも◯◯アドセンスとかが入っているのだと思います。
●サイト運営者→◯◯アドセンス→広告代理店→スポンサー(今回は詐欺会社)

>ポップアップは無視するようにします。

ポップアップブロックの設定をしましょう。

Safariでポップアップ広告やポップアップウインドウをブロックする
https://support.apple.com/ja-jp/102524