通知音設定

スマホ自体の音は鳴る、ラインも通話の着信は鳴る、メッセージの通知だけ鳴らないし、その設定もできないということでしょうか。

だとすれば、LINEアプリの挙動がおかしいのでしょうから、アプリの更新があるようならアップデートしてみる。
それでもダメなら一度アプリをアンインストールして、再インストールしてみてはいかがですか？