iPhone6s機種変及びデーター移行

＞①機種変を考えてますが、Appleで購入したほうがいいのでしょうか？

新品を購入するなら、Appleから購入するのが最も安心だと思います。
通信契約とセットだと割引で買えるケースもありますが、落とし穴とか、トータル金額検討とか、短期解約ブラックリストとか、調べることが多いしリスクも発生するので。

＞②SIMフリーが、いいのですか？

絶対にSIMフリーの方が良いです。
SIMフリーである事にデメリットはないです。
ちなみに、Appleで購入すれば特別に指定しない限りSIMフリー品を購入できます。

③データー移行は、簡単ですか？

色々な方法がありますが、クイックスタートが比較的簡単です。
iphone6S→iphone12(or13)ならクイックスタートが使えます。

割とわかりやすいかな、と思うサイトを貼っておきますね。

『機種変更時にiPhoneをかざすだけでデータ移行！『クイックスタート』の手順と注意点』
https://time-space.kddi.com/mobile/20200107/2812

あと、上記の「クイックスタート」だとLINEは移行できません。
LINEは単独で引継ぎしてください。

『LINEあんぜん引き継ぎガイド』
https://guide.line.me/ja/migration/migration_a/

iphone→iphoneなので、ほとんどこれで引継ぎできると思います。
ただ、利用しているアプリによってはLINEのように個別な引継ぎが必要な場合があるので、しばらくは旧端末（iphone6s）もそのまま保管しておいた方が無難だと思います。