アップルストアで購入したSIMフリーiPhoneをソフトバンク契約で使えますか？

持ち込み機種変更の手続きは、使用端末をSoftbankに登録するだけのことだと思いますので必須ではありません。

SIMフリーiPhoneなら、SIMを差し替えるだけで使えます。
新しい端末を使い始めるとき、iMessageのアクティベーションに少し時間が掛かるかもしれません。