iPhone SE 第二世代の不具合について

さすがに3回続けて初期不良は可能性が低いので、下記の指示は妥当に思います。
>初期化して、自分で入れたアプリを全て省いて使ってみるように

LINEなど多くの人が使っているアプリはまず大丈夫です。初期化の後はメジャーなアプリだけの最小限のアプリでしばらく使ってみてください。
一度不具合が起きるとそのアプリをアンインストールしても不具合が残ることもあります。

もし書けるなら、お使いのアプリでユーザーが少なさそうなアプリ名をリストアップしてみてください。それが難しければ、ご自分で各アプリ名を検索して不具合情報がないか確認してみてください。