iphoneのappleでの電池交換に関して

電池交換半額プログラムを利用して、電池交換をしようと思っております。バックアップが必須なのは承知いたしております。
（修理等でアップルで端末交換等、利用したことがございますので）

アップルで電池交換される際、初期化は必ずされるのでしょうか。

アプリ内（clipboxやmusicFM）に保存されている音楽
が消えてしまうのかどうかが気になって質問いたしました。

端末を修理・交換した際は、バックアップを取っていたにもかかわらず
アプリ内のデータが飛んだ（消えた）記憶があるので、
データ移行をどこまでしようか悩んでおりまして。

アップルで電池交換（できれば半額プログラム）を利用された方
いらしっしゃいましたら、返信いただけると嬉しいです。