auのiphone6からsimフリーの6s

電話できるということは、左上に「au 1ｘ」と出ていますか。

もしそうであれば、本体は正常に動作していますが、プロファイルの読み込みがうまくいっていないということを意味しています。

一般→リセット→「すべての設定をリセット」を行って、改めてプロファイルを入れてみてください。WiFiの設定も改めてやらないといけなくなると思います。

この現象は、auから移ったばかりのときと、iOSをバージョンアップしたときによく起こることですので、それほど心配することはありません。