ドコモの電話帳とか邪魔なので消したいのですが…

プリインアプリをアンインストールするのは
私は夢の中でしかやったことがありません。
すっきりして私としては使いやすかったですが、
現実の世界で尚且つ、こういう質問をするレベルの方には
お勧めできないなと思いました。

プリインアプリをアンインストール状態で扱うなら
まずそれが自分で出来て、何かあっても全て自己解決出来る方でないと
厳しいと思われます。

もちろんdocomoにて保証対応や故障対応はしてもらえません。

簡単に言うと皆様がおっしゃるようにアプリ無効程度にしておく事を
オススメします。

どうしても素の、もしくは素に近いAndroidがいいならSIMフリーで
お選びになればいいかと思います。