iPhone lightning端子を掃除するのに良い物は？

段階を踏んだ作業で、改善しないかどうかを確認していくのが良いと思います。
まずは、本体コネクタ内の異物吸引(掃除機)、ケーブル端子のほうの接点復活(接点洗浄スプレーの後、復活剤)。
次に、本体端子の洗浄(洗浄剤の染みた綿棒）。
それでも改善しないなら、本体端子の接点復活(復活剤の染みた綿棒)。

接点を改善させるのに必要なのは、
洗浄スプレーで汚れを洗い流すことと
復活剤を極少量だけ塗布することです。
接点復活スプレーというのは、この2工程を豪快に纏めても問題ない場所に使う物ではないでしょうか。

とはいえ風呂での使用で本当にカビが発生しているのでしたら、スプレーで飛ばす必要がありますよね。
取れたゴミが運良く外に出てこなかった場合、一時的に良くなっても本体の寿命を縮めるでしょうから、最後の手段です……。