ご利用番号が2回線あっても、片方の容量しか使えない。

おそらく2回線の契約をしているのだと思います。
データ容量は回線ごとになっていますので、使っているSIMカードに紐づいたデータだけが消費されてしまいます。

同一IDでもパケットギフトができるようになりましたので、容量が減っていない回線からパケットギフトで移したいパケットを設定し、少なくなっている回線へ移動させると良いですよ。