回線追加の時はmineoIDは同一か新規別ID　どちらが良いでしょうか?

①はご認識のとおりですが、②③は同一IDだとアプリ内で回線を切り替えるだけ（要はいずれも自分の回線）なのでラクチンです。
別IDだとそれぞれアプリを用意するか、ログアウトーログインを繰り返す必要がありますね。