端末購入時のマイナンバーカード本人確認でエラー

役所が間違えたというわけでもないです。

１．署名用電子証明書 （英数字6文字以上、16文字以下）
２．利用者証明用電子証明書 （数字４文字）
３．住民基本台帳用 （数字４文字）
４．券面事項入力補助用 （数字４文字）

の４種類の暗証番号がありますが、３と４は設定必須、１と２は任意ですが、コンビニで住民票等を発行するには２の登録が必要ですし、e-Tax や本人確認に使用するには１の設定が必要となります。

だから、結局マイナンバーカードを実用的に使うためには４つとも設定しないと意味がないということになります。

役所が謝ったというのは、きちんと本人に確認しなかったことに対して謝ったということです。