料金収納手数料とは？

私もデビットカードで支払いをしていますが、収納手数料は取られたことがありません。

数カ月前、mineoがデビットカードの引き落とし日を、マイページでの開示よりも前の9日前後に改めました。それまでは16日前後でした。それで、いつも通りだと思っていた私は残高不足になってしまい、請求書で支払いました。

そのときは、mineo側の通知不足ということで収納手数料は取られなかったのですが、その後、今後は残高不足で引き落としにならない場合は手数料を取るよというメールが来ました。
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【重要】引き落としタイミングの変更について

本メールはデビットカードおよびプリペイドカードでお支払いのお客さまへお送りしています。
平素はmineo(マイネオ)サービスをご利用いただき、誠にありがとうございます。
デビットカードおよびプリペイドカードでのお支払いについて、2019年10月からご請求情報の開示前にお客さまの口座からご利用料金を引き落としさせていただくこととなりました。
引き落としができなかった場合、請求書でのお支払いとなり、発行手数料(請求書一通につき税抜300円)が必要となります。
毎月5日頃までに口座へご準備いただきますようお願いいたします。
今後とも弊社サービスをご愛顧いただきますよう、よろしくお願いいたします。
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今回の料金収納手数料（２月送付分）330円というのは、この請求書発行手数料のことだと思います。

今回一回限りだと思うのでとりあえずは様子見して、今後もまた引き落としされるようであれば、mineoに問い合わせ・抗議をしたほうがよいと思います。