家族割引適用してくれるのでしょうか

eoIDを同じにした場合の注意事項として…
これは確かヨッシーセブンさんが良く書かれていたことと記憶していますが、mineoアプリで息子さんが連携電話番号を勝手に変えないように設定しておきます。
連携電話番号が変えられると、パケット移動が自由にできてしまいます。

大前提として、eoIDのパスワードを息子さんに教えないようにする必要があります。