MNP転入エラー

> 物理simを入れる事で通信はできる
これは転出元のSIMですか？別の回線のSIMですか？前者ならMNPができていないことになります。

「MNP転入のエラー」とは具体的にどうなったのでょうか。通常は回線切替をすると転出元が圏外になり、転入先のmineoが有効となります。
DプランeSIMのiPhoneの組み合わせの場合、回線切替でeSIMプロファイルが自動インストールされます。この時点で通話やSMSが使えるようになります。あとはmineo Dプラン用APN構成プロファイルのインストールで通信もできるようになります。
eSIMプロファイルを削除してしまったと言うことありませんか？その場合でもmineoは開通したことになっています。mineoマイページで契約内容を確認してみてください。

■契約内容確認
https://support.mineo.jp/setup/guide/keiyaku.html