複数割と家族割の回線数について

>Aはすでに割引を5回線適応しているのですが、更にCeoIDの1回線を家族割適応に出来るのでしょうか。

適用されます。
1eoIDにつき契約可能なのは5回線なので、複数回線割も上限は同じです。これは同じeoIDで複数回線を契約すれば自動的に適用されます。
家族割は回線数の上限は特にありません。家族（異なるeoID）で契約した回線数だけ申し込めば適用されます。

複数回線割と家族割は同時に適用されず、家族割が優先されます。
ですので、AのeoIDでは1回線が家族割で、残り4回線が複数回線割になっているかと思います。