持ち込み保障について

こんにちは。
他の方が仰っている通り、iPhone6s共通の不良の可能性がありますのでまず一度Appleに相談されるのがよいかと思います。
共通の不良とAppleが認めていますので、原因がそれであると判断されれば無料修理が可能です。

持ち込み端末保障サービスに関しては自分はiPhone6で依頼を出しましたが、全交換となり同仕様のまま交換品が来ました。
ケースバイケースかとは思いますが、制度を理解していれば悪いシステムとは思いません。
ただし確認1つ・修理1つ・代機手配1つ取っても非常に時間がかかるため、修理中に使用する予備機をあらかじめ持っていないと利用しづらいサービスであるとは少々感じます。
あとの良し悪しは人によって感想も違うと思いますので最終的な判断はご自分でされるのがよいかと思います。