ショートカットが出ない

pukubonnさん、こんばんは♪

これはホーム画面に LINE等のアプリのアイコンが無いということでしょうか？
復元にインストールも出来ているとのことですので、ちょっとお手間かと思いますがアプリ一覧を開いて、1つ1つホーム画面に移動してみてください。
（ホーム画面にあるアプリは ただのショートカットアイコンですので）

イメージし易い記事やレポートがマイネ王ではちょっと見つけられなかったので、外部リンクで恐縮ですが、下記のサイトをご覧の上 作業されてみてくださいね。

ホーム画面にアプリのアイコンを表示
https://hayakute.kantan-sakusaku.com/android/2015/0112105858/

あと次回も初期化したり、または機種変された時もそうなのですが、ホーム面に並べてるアプリの「並び順」って、前回はどうしてたかな？って気になることがあるかと思います。

そんな時はホーム画面のスクショを撮って保存してくださいね。
次回の設定時にスクショがあると とっても便利ですよ～！(^^ゞ