マイページの「ご利用番号選択」の際に電話番号をタップすると発信しようとする

おはようございます、リルムさん

iOSでSafariを使う場合の仕様です。
2番目の回答にあるように他のブラウザを使われるか、後はマイページの契約番号から発信しないように仕様変更してもらうですね。
この場合はアイディアファームで提案しないと難しいと思います。
ただし、提案しても採用されるかどうかは運営事務局の判断です。

自分のマイページから自分の携帯に発信するケースは、あまりというかほとんどないような気がします。
マイページに関してはリンクを外すように変更したほうが合理的かもしれませんね。