ahamoの物理SIMとマイネオのe SIMっデュアルで使えないよね？

ahamoは、iPhoneでは自動的にAPN設定されます。
mineoは、eSIMであろうと、プロファイルインストールが必要です。

プロファイルは、一つだけインストール出来るので、不要であるahamoとの組み合わせなら何も問題ありません。

プロファイルがどちらも必要な場合には、データ通信するSIMを切り替えるたびに、プロファイルを再インストールしなければならなくなるので、面倒ではありますが、使えないわけではありません。