AプランからDプランへ変更時のプロファイルについて

おっしゃるとおり、Aのプロファイルを削除し、DのプロファイルをインストールするだけでOKです。

私も先日てつたろうさんと同じ理由からプラン変更しましたが、私の場合だと、
・変更受付メール受信から5日後の夜に手続き完了メールを受信
・その翌日の夜にau回線が停止されて圏外に
・さらにその翌日にDプランのSIM到着
という流れでした。
圏外と表示されていてもwifi接続は可能です。