auのsimとの使い分け

先に回答されているように，mineoを使うときには，mineoのプロファイルをインストールし，その後auを使うときにはmineoのプロファイルを消せばauのほうが利用できます。これは実際にやりました。
プロファイルのインストールや削除は，sim交換後でも可能ですが，インストールにはインターネット接続が必要なため，mineoのsimを先に入れてしまうと，Wifiがないとプロファイルのインストールもできませんので注意してください。

あと，今後mineoのみで使うのであれば，au系のプロファイルは一度すべて消してしまったほうがいいと思います。ただし，メールのプロファイルを消すと，iPadのメールアプリ内のメールがすべて消えるため，これだけは気を付けてください。