SIMは同じ？iPhone6からiPhoneSE(第2世代)

順番にお答えいたします。

>>現在、mimeo通話付きDプランを契約中ですが、同じSIMを使えますか？

使えますよん☆♪

>>新しい SEは、クィックスタートで移行してSIMを入れ替えるとすぐに使えますか？

正確に申し上げますと、iPhoneSE 2020の 見た目は「docomo 4G」と出ていても、電話だけが使えて インターネット通信は使えません。
...ですので、APN構成プロファイルをダウンロード・インストールしなければいけません。
プロファイルは端末依存のため、クイックスタートであっても移行されません。APN構成プロファイルのダウンロード・インストールは、mineoアプリから行います。

なお、クイックスタートは新旧両方とも最新iOSにアップデートしてから移行するようにしてください。