iPhone6sのsimフリー化

＞ネットで申し込む場合、何かiPhone上の変化はあるのでしょうか？

iPhone本体には何の変化もありません。simロック解除の申し込みをすると、その事実がアップルのサーバーに登録されるだけです。

iPhone本体のほうは、他社製のsimを差し込んだとき、もしくは工場出荷状態に戻したときにsimロック解除がされて、改めてアクティベーションの画面が表示されます。

早い話が、au版もドコモ版もソフトバンク版も中身は全く同じで、出荷されるときに、au simロックあり、ドコモsimロックあり、ソフトバンクsimロックありとしてアップルのサーバーに登録された上で出荷されます。simロック解除の申し込みをすると、今度アップルのサーバー上での登録がsimロックなしに変更となります。

＞simフリー化する前にしておかなければならないことはありますか？

特別何もありません。