【iPhone】【iPad】同じApple IDを使っている場合の機種変更

私も似た使い方しています
iCloudはほぼ使っていません（せいぜい連絡先のバックアップぐらい）
いままでiPhoneは何度か買い替え
iPadはそのままで使っていますが、特に支障はありません。
というか、ipadはほぼ無視してます(^^

ただ、同じAppleIDだとアプリの購入履歴が共通になるので
全く区別することは難しいと思います。
例えば端末に入っているアプリはそれぞれ異なっていても
無料を含む購入履歴は、同じになっていると思います。
（履歴がiPad から見えてもいいなら今までの使い方で問題ありません）

iPhoneの機種変更の際は
クイックスタートか、PcとiTunesを利用したデータ移行が良いと思います。
私は、バックアップの意味も含め
iTunesでのバックアップでデータを移しています。