楽天モバイルの紹介は、電話回線毎なのでしょうか？

紹介は楽天モバイル回線に紐づいた楽天IDでなされ、特典は楽天IDへされます。
紹介時の楽天回線が特典付与時にないと、楽天IDとの紐付けが分かりませんと難癖を付けられる可能性がありますから、特典付与はでは回線維持することをお勧めします。
https://network.mobile.rakuten.co.jp/campaign/referral/#campaign-rule-table