通話アプリは何がおすすめですか？

目的や環境ににより最適なアプリは変わります。
音質がある程度重要だったり緊急通報や相手番号に依存しない事(または面倒なことを考えたくない)なら070/080/090の通話が最適で、少しでも安くしたいならこれに楽天でんわを契約して運用するのが現在はベストだと思います。楽天でんわは楽天系ですが以前はフュージョンというそれなりに有名どころだった電話会社が運営しているので音質や遅延はあまり目立たず番号通知も大抵通ります。かからないときは楽天でんわアプリ以外で発信すれば普通の通話になります。
発信者番号の通知は050番号でもできなければ困るが安くあげたいならlalaコールや050plusが固定電話宛なら安価です。両者の通話料はよく似ていて、lalaコールはmineoならカウントフリーだったり固定費が安いので050plusやOCN系のIP電話を使っている人とよく連絡する場合(050plusは050plusやOCN系のIP電話と通話無料)以外はlalaコールで問題ないと思います。
また、通話録音が欲しいときや固定電話よりも携帯電話にかけることが多く、短い用件主体ならIP phone smart(Smartalk)を使うのが便利です。
料金は30秒あたり8円なので固定電話にかけると050番号のアプリとしては高めですが携帯電話宛てなら30秒毎課金なので安くつく場合が多く、基本料不要でアプリに通話録音があり、専用アプリ以外も使えるなど使い勝手が良いです。
番外編として、相手がandroid携帯電話だけで比較的新しい機種ならハングアウトとGoogleDuoという手もあります。品質はともかく料金不要でGoogle提供なので余計な相手に情報をばらまかずに済みます(Googleにはスマホのアカウント登録時点で既に情報を渡しているので)
なお、私の環境はlalaコールと050plusとIP phone smart併用ですが一番通話でよく使うのはVPN経由で自宅のIP電話サーバを介したドットフォンの通話です、OCN網で自宅サーバで通話録音と多者通話もできて着信は自宅サーバが自動アテンダントしてくれるので便利ですが当然ながらかなり逸汎的(趣味としては既に狂気の領域かも)なので参考にならないかと思います。